Genetic diversity of Newcastle disease viruses circulating in wild and synanthropic birds in Ukraine between 2006 and 2015
Завантаження...
Дата
2023
Назва журналу
ISSN журналу
Назва тому
Видавець
Frontiers Veterinary Science лицензии Creative Commons Attribution License (CC BY)
Анотація
Newcastle disease virus (NDV) infects a wide range of bird species worldwide and is of importance to the poultry industry. Although certain virus genotypes are clearly associated with wild bird species, the role of those species in the movement of viruses and the migratory routes they follow is still unclear. In this study, we performed a phylogenetic analysis of nineteen NDV sequences that were identified among 21,924 samples collected from wild and synanthropic birds from different regions of Ukraine from 2006 to 2015 and compared them with isolates from other continents. In synanthropic birds, NDV strains of genotype II, VI, VII, and XXI of class II were detected. The fusion gene sequences of these strains were similar to strains detected in birds from different geographical regions of Europe and Asia. However, it is noteworthy to mention the isolation of vaccine viruses from synanthropic birds, suggesting the possibility of their role in viral transmission from vaccinated poultry to wild birds, which may lead to the further spreading of vaccine viruses into other regions during wild bird migration. Moreover, here we present the first publicly available complete NDV F gene from a crow (genus Corvus). Additionally, our phylogenetic results indicated a possible connection of Ukrainian NDV isolates with genotype XXI strains circulating in Kazakhstan. Among strains from wild birds, NDVs of genotype 1 of class I and genotype I of class II were detected. The phylogenetic analysis highlighted the possible exchange of these NDV strains between wild waterfowl from the Azov-Black Sea region of Ukraine and waterfowl from different continents, including Europe, Asia, and Africa. Вірус ньюкаслської хвороби (ВНХ) інфікує широкий спектр видів птахів у всьому світі і має важливе значення для птахівничої галузі. Хоча певні генотипи вірусу чітко асоціюються з дикими видами птахів, роль цих видів у поширенні вірусу та міграційні шляхи, якими він рухається, залишаються нез'ясованими. У цьому дослідженні ми провели філогенетичний аналіз дев'ятнадцяти послідовностей NDV, які були ідентифіковані серед 21 924 зразків, зібраних у диких і синантропних птахів з різних регіонів України з 2006 по 2015 рік, і порівняли їх з ізолятами з інших континентів. У синантропних птахів виявлено штами NDV генотипів II, VI, VII та XXI класу II. Послідовності злитих генів цих штамів були подібні до штамів, виявлених у птахів з різних географічних регіонів Європи та Азії. Однак слід зазначити, що виділення вакцинних вірусів від синантропних птахів свідчить про можливість їхньої ролі у передачі вірусу від вакцинованої птиці до диких птахів, що може призвести до подальшого поширення вакцинних вірусів в інші регіони під час міграції диких птахів. Крім того, тут ми представляємо перший публічно доступний повний ген NDV F ворони (рід Corvus). Крім того, наші філогенетичні результати вказують на можливий зв'язок українських ізолятів NDV зі штамами генотипу XXI, що циркулюють у Казахстані. A Серед штамів, отриманих від диких птахів, були виявлені НДВ генотипу 1 класу I та генотипу I класу II. Філогенетичний аналіз показав можливий обмін цими штамами НДВ між дикими водоплавними птахами Азово-Чорноморського регіону України та водоплавними птахами з різних континентів, включаючи Європу, Азію та Африку.
Опис
Ключові слова
NDV, Avian orthoavulavirus 1, surveillance, sequencing, bird migration, synanthropic, pigeon, Ukraine, пташиний ортоавулавірус 1, епіднагляд, секвенування, міграція птахів, синантропний, голуб, Україна
Цитування
Genetic diversity of Newcastle disease viruses circulating in wild and synanthropic birds in Ukraine between 2006 and 2015 / I. V. Goraichuk, A. Gerilovych, V. Bolotin, O. Solodiankin, K.-M, Dimitrov [et al.] // Frontiers Veterinary Science. – 2023. – T. 10. – Pp. 1–13. – Section Veterinary epidemiology and economics: 10:1026296. doi: 10.3389/fvets.2023.1026296-2023.