Перегляд за Автор "Gaidash, O."

Зараз показано 1 - 3 з 3
  • Зображення мініатюри
    Документ
    Complete Genome Sequence of an Avian Orthoavulavirus 13 Strain Detected in Ukraine
    (Microbiology Resource Announcements, 2023) Goraichuk, I. V.; Muzyka, D.; Gaidash, O.; Gerilovych, A.; Stegniy, B.; Pantin-Jackwood, M. J.; Miller, P. J.; Afonso, C. L.; Suarez, D. L.
    We report the complete genome sequence of an avian orthoavulavirus 13 strain, isolated from a white-fronted goose in the Odesa region of Ukraine in 2013. The detection of avian orthoavulavirus 13 in Ukraine confirms that the geographic distribution of this virus extends beyond Asia. Ми повідомляємо повну послідовність генома пташиного ортоавулавірусу 13 штам, виділений від гуски білолобої в Одеській області України в 2013 р. виявлення ортоавулавірусу птахів 13 в Україні підтверджує, що географічне поширення цього вірусу поширюється за межі Азії.
  • Зображення мініатюри
    Документ
    Discovery of Avian Paramyxoviruses APMV-1 and APMV-6 in Shorebirds and Waterfowl in Southern Ukraine
    (Creative Commons CC BY, 2022-06-23) Klink, A. C.; Rula, O.; Sushko, M.; Bezymennyi, M.; Mezinov, O.; Gaidash, O.; Bai, X.; Stegniy, A.; Sushko, M.; Datsenko, R.; Skorohod, S.; Nedosekov, V.; Hill, N.; Ninu, L.; Kovalenko, G.; Ducluzeau, A; Mezhenskiy, A.; Drown, D.; Causey, D.; Stegniy, B.; Gerilovych, A.; Bortz, E.; Muzyka, D.
    Emerging RNA virus infections are a growing concern among domestic bird and poultry industries due to the severe impact it can have on the flock health and economic livelihoods. Avian paramyxoviruses (APMV) are pathogenic, negative sense RNA viruses that cause serious infections in the respiratory and central nervous system. APMV was detected in multiple avian species during the 2017 migration season in Ukraine, and studied using PCR, virus isolation, and sequencing. Of the 4090 wild bird samples, eleven swabs were isolated in chicken embryos and identified for APMV serotype by hemagglutinin inhibition test: APMV-1, APMV-4, APMV-6, APMV-7. At a variety of sites in Ukraine we characterized the virulence of the virus and further analyzed and predicted the potential risks of spillover to immunologically naïve populations. RNA was extracted and amplified using a multiplex-tiling primer approach to encompass full APMV genomes. Full-length APMV-1 (n=5) and APMV-6 (n=2) genomes were sequenced on an Oxford Nanopore MinION device in Ukraine. All APMV-1 and APMV-6 fusion (F) proteins possessed a monobasic cleavage site, suggesting these APMV were likely low virulence, annually circulating strains. Utilization of this lowcost method will identify gaps in viral evolution and circulation in this understudied but important critical region for Eurasia. Нові РНК-вірусні інфекції викликають дедалі більше занепокоєння серед домашнього птахівництва та птахівництва через серйозний вплив, який вони можуть мати на здоров’я стада та економічні засоби існування. Пташині параміксовіруси (APMV) — це патогенні РНК-віруси негативного сенсу, які викликають серйозні інфекції дихальної та центральної нервової системи. APMV був виявлений у кількох видів птахів під час міграційного сезону 2017 року в Україні та досліджений за допомогою ПЛР, ізоляції вірусу та секвенування. З 4090 зразків диких птахів одинадцять мазків були виділені в курячих ембріонах і ідентифіковані на APMV серотип за тестом інгібування гемаглютиніну: APMV-1, APMV-4, APMV-6, APMV-7. У різних місцях в Україні ми охарактеризували вірулентність вірусу та додатково проаналізували та передбачили потенційні ризики поширення на імунологічно наївні групи населення. РНК екстрагували та ампліфікували з використанням праймерного підходу мультиплексного тайлінгу, щоб охопити повні геноми APMV. Повнорозмірні геноми APMV-1 (n=5) і APMV-6 (n=2) секвенували на пристрої Oxford Nanopore MinION в Україні. Усі злиті (F) білки APMV-1 і APMV-6 мали одноосновний сайт розщеплення, що свідчить про те, що ці APMV, ймовірно, були низьковірулентними штамами, що циркулювали щорічно. Використання цього недорогого методу дозволить виявити прогалини в еволюції та циркуляції вірусу в цьому маловивченому, але важливому для Євразії регіоні.
  • Зображення мініатюри
    Документ
    Research despite the war: surveillance of emerging viral and bacterial pathogens in wild birds and animals in Ukraine
    (Swedish Veterinary Agency, SVA, 2024-09-25) Muzyka, D.; Rula, O.; Muzyka, N.; Mezinov, O.; Vlaschenko, A.; Echkenko, R.; Popova, A.; Yurko, P.; Gaidash, O.; Pantin-Jackwood, M.; Beer, M.; Fair, J.; Owen, J.; Waldenström, J.
    Background and objectives: Wild birds and animals are hosts to many pathogens that pose a risk to humans and domestic animals, such as influenza A virus, flaviviruses, coronaviruses, avian avuloviruses, tick-borne viruses, pathogens and drug-resistant bacteria. Surveillance for such pathogens is vital for predicting and preparing for future outbreaks and pandemics. The war in Ukraine is creating new challenges for One Health, and is spreading beyond Ukraine to the whole of Europe..Materials and Methods: Surveys of emerging wildlife pathogens were conducted in Ukraine from 2009-2024. Classical virological, serological, PCR, and equencing methods were used for the study. Results: Surveillance efforts continue despite the war in Ukraine that began in 2014 and the full-scale invasion in 2022. Передумови та цілі: дикі птахи та тварини є господарями багатьох патогенів, які становлять небезпеку для людини і домашніх тварин, таких як вірус грипу А, флавівіруси, коронавіруси, пташині авуловіруси, віруси кліщів патогени та бактерії, стійкі до ліків. Спостереження за такими патогенами є життєво важливим для прогнозування та підготовки для майбутніх спалахів і пандемій. Війна в Україні створює нові виклики для One Health, і поширюється за межі України, на всю Європу.Матеріали та методи: Дослідження нових патогенів дикої природи проводилися в Україні з 2009-2024. Для дослідження використовували класичні вірусологічні, серологічні методи, ПЛР та секвенування. Результати: Зусилля зі спостереження тривають, незважаючи на війну в Україні, яка почалася в 2014 році, і повномасштабне вторгнення в 2022 році.